Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhox9Q9EQM5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhox9Q9EQM5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rhox9Q9EQM5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rhox9Q9EQM5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rhox9Q9EQM5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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