Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ndst3Q9EQH7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ndst3Q9EQH7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ndst3Q9EQH7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ndst3Q9EQH7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms