Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG3

Scel, Sciellin, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScelQ9EQG3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScelQ9EQG3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms