Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Clstn1Q9EPL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clstn1Q9EPL2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms