Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf6Q9DBU5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf6Q9DBU5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf6Q9DBU5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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