Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc97Q9DBT3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc97Q9DBT3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms