Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PacrgQ9DAK2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PacrgQ9DAK2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms