Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Q9DAA3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms