Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc89Q9DA73 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms