Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmbim4Q9DA39 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms