Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smco2Q9DA21 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smco2Q9DA21 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms