Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp12Q9D9M2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp12Q9D9M2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms