Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbc1d20Q9D9I4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tbc1d20Q9D9I4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms