Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg7Q9D906 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg7Q9D906 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms