Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1qtnf2Q9D8U4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1qtnf2Q9D8U4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms