Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fip1l1Q9D824 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms