Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn22Q9D7U6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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