Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rep15Q9D7T1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rep15Q9D7T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms