Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9D7E4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms