Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf225Q9D7D1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms