Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Speer4f1Q9D5Q6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms