Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc130Q9D516 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc130Q9D516 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms