Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl3Q9D4V7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl3Q9D4V7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms