Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc83Q9D4V3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms