Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf6Q9D4J7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms