Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lonrf3Q9D4H7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lonrf3Q9D4H7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms