Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms