Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpn3Q9D3W4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms