Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Katnal2Q9D3R6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Katnal2Q9D3R6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms