Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt20Q9D312 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt20Q9D312 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms