Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc6bQ9D289 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Trappc6bQ9D289 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trappc6bQ9D289 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Trappc6bQ9D289 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Trappc6bQ9D289 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc6bQ9D289 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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