Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Spns3Q9D232 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms