Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tspan11Q9D1D1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tspan11Q9D1D1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms