Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Susd3Q9D176 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Susd3Q9D176 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms