Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ss18l2Q9D174 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms