Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Upk1aQ9D132 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upk1aQ9D132 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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