Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed3Q9D0L1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms