Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2e1Q9D0D5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms