Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Thumpd2Q9CZB3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thumpd2Q9CZB3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms