Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Gm17509Q9CZ61 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm17509Q9CZ61 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm17509Q9CZ61 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Gm17509Q9CZ61 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17509Q9CZ61 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms