Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snf8Q9CZ28 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snf8Q9CZ28 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms