Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssu72Q9CY97 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssu72Q9CY97 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms