Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Bud23Q9CY21 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bud23Q9CY21 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bud23Q9CY21 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms