Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmed5Q9CXE7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmed5Q9CXE7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms