Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Xrcc3Q9CXE6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Xrcc3Q9CXE6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Xrcc3Q9CXE6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Xrcc3Q9CXE6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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