Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ist1Q9CX00 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ist1Q9CX00 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms