Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CWU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms