Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tdrd12Q9CWU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms