Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot11Q9CWN7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot11Q9CWN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms