Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NubplQ9CWD8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms